小便后疼痛可能是尿道炎、尿道结石、膀胱结石等原因导致。建议患者到医院就诊，完善检查，明确病因，采取相应的治疗。
1、尿道炎膀胱出口至尿道外口的尿道黏膜发生炎症反应，引起尿道炎造成，并伴有烧灼感、下腹部坠胀感等症状。
2、尿道结石肾结石或者膀胱结石随着尿液排出时，阻挡或者卡顿在尿道，引起尿道结石造成，部分患者也会出现阴囊和会阴部疼痛不适感。
3、膀胱结石营养不良，或者肾脏、输尿管等上尿路发生结石，随着尿液排入膀胱等原因，形成膀胱结石，当结石梗阻到尿道入口或者进入尿道时引起。
此外，患有膀胱炎等疾病也可能导致。
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