黑色小肉粒可能是尖锐湿疣，也可能是色素痣、毛囊炎，具体病因需要去医院进行详细检查之后判断。

尖锐湿疣属于性传播疾病，常见于性活跃的青年和中年人群，大多是由人乳头瘤病毒感染引起，可导致患者肛门或者是外生殖器的皮肤黏膜出现黑色小肉粒，随着病情发展，患者可出现局部糜烂、渗液、破溃、出血等不适症状。

如果有色素痣，皮肤表面会有黑色的肉粒。色素痣主要是痣细胞增生引起的，皮肤表面会出现黑色素增生样改变，大多呈小疙瘩肉粒状，此种情况一般属于正常的生理现象，不需要进行特殊治疗。

如果患有毛囊炎，毛囊被堵塞后，毛囊内的分泌物可能无法排出，会导致黑色的肉粒疙瘩。患者可遵医嘱使用抗菌消炎的药物治疗，如夫西地酸钠软膏、莫匹罗星软膏等。

对于长黑色肉粒的患者，建议前往医院诊治，找到病因进行针对性治疗，以免耽误病情，危害身体健康。