1、并发口腔感染

口腔感染主要是在患病期间不注意口腔卫生及不进行口腔护理导致患者出现以口腔溃疡为主要特点的并发症。口腔感染通常以口腔溃疡最为多见。

2、并发支气管肺炎

支气管肺炎是流行性乙型脑炎常见的并发症之一，尤其是对于咳嗽及吞咽反射减弱、消失、昏迷的患者最容易发生支气管肺炎。人体感染乙型病毒正是引发支气管肺炎的主要病毒之一。

3、并发肺不张

由于流行性乙型脑炎患者严重时不能自主进行咳嗽、吞咽反射时。呼吸道内的分泌物也不能顺利排出，越聚越多，到最后就会引起肺不张。肺不张是指一个或多个肺段或肺叶的容量或含气量减少。通常表现为胸闷、气急、呼吸困难、干咳，合并感染时，还会可引起患侧胸痛，突发呼吸困难和发绀、咳嗽、喘鸣、畏寒和发热、心动过速、体温升高、血压下降等诸多症状。

4、并发败血症

乙型脑炎患者还有可能感染金黄色葡萄球菌，引发败血症。败血症主要是指致病菌或条件致病菌侵入血循环，并在血液中繁殖，引发全身性疾病的一种疾病。败血症的主要表现高热、皮肤损伤、呕吐、腹泻、关节腔积液、肝、脾肿大等疾病。