双肾长有小囊肿，首先得确定囊肿的性质，是恶性的还是良性的，然后才是采取治疗，治疗双肾囊肿的方式有以下几种一，是药物治疗双肾囊肿，这种治疗方法是属于保守治疗，尤其是针对良性的小囊肿，很多都是可以采取药物进行控制住的。二，手术切除，手术切除囊肿，多数是针对于囊肿较大，且危害性较大的人群，切除后需要注意对肾脏的保养。三，放射治疗，针对于肾脏囊肿较多，分布不均匀，且肾脏能力较差的患者使用。