氨基多糖季铵盐冲洗液可能有副作用，在使用的过程中可能会引起神经刺激性反应，也有可能会出现过敏性反应，每个人的体质不同，所以在使用期间产生的影响程度会有所不同。
1、神经刺激性反应：氨基多糖季铵盐冲洗液在使用的过程中可能会导致神经刺激性的反应，容易表现出头晕或者头痛的症状，也有出现精神不振的可能性。
2、过敏反应：氨基多糖季铵盐冲洗液在使用的过程中，部分人群因为个人体质原因可能会出现过敏反应，容易引起过敏性鼻炎发生，也有可能会引起过敏性哮喘，容易引起鼻塞和鼻痒的症状，同时不排除有呼吸不畅的可能性，但是发生过敏的可能性比较小。
氨基多糖季铵盐冲洗液可以起到抗菌的作用，对于多种疾病能够达到治疗的作用，比如可以用于肿瘤疾病的辅助治疗，也可以用于性病的辅助治疗，同时对于皮肤病也能够起到辅助治疗的作用。治疗的过程中需要观察自身的情况，如果出现了药物较严重的副作用，则需要及时的减少或者停止用药，可以降低产生的影响。
