1.肝纤维化并发症 纤维化的主要并发症多见于于血吸虫病晚期，有食管下段或胃底静脉曲张，曲张静脉破裂可引起上消化道大出血，表现为大量呕血与黑粪，导致血压下降与失血性休克。上消化道大量出血后可出现腹水或并发肝性脑病，肝性脑病国内有报告，但不多见。晚期血吸虫病还可合并其他细菌性感染。
2.阑尾炎 在流行区患者并发阑尾炎的比例较高。在流行区患者被切除阑尾标本中找到血吸虫卵者可高达31%。湄公血吸虫病是急性阑尾炎的一大诱因。由于阑尾较易穿破，血吸虫自阑尾中散出可引发腹膜炎或局限性脓肿。
3.结肠病变 血吸虫病可引起不完全性肠梗阻，以位于乙状结肠与直肠为多。此外，肠系膜与大网膜病变可粘连成团，形成腹内痞块。血吸虫病患者结肠肉芽肿可并发结肠癌。患者年龄较轻，大多为腺癌，恶性程度较低，转移较晚。
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